之后火箭队想抢夺宝可梦中心的所有宝可梦还有超进化石，不过被超级差不多娃娃最后被皮卡丘打飞。
之后发生了一些事情看到一只小狮狮离开族群开始独立，以及皮卡丘和喵喵因为达克莱伊的原因误打误撞进入小软的梦境的事情。
一处山洞中一群忍者正预谋着什么
戴着双斧战龙面具的男子:“作战内容如上所述，绝对不可以轻忽大意，各位要铭记在心。”
“我们忍者军团不论在何时何地都永远效忠于你，景友大人，英勇辉煌。”
“英勇辉煌……”
“你等着瞧吧半藏。”
另外一边小雪和小智正在特训长尾火狐和呱头蛙正在努力。
而小软通过细胞看到了两个身影，小雪的甲贺忍蛙突然出现和呱头蛙朝那个地方发动了攻击。
三平和甲贺忍蛙出现
三平:“真是漂亮。”
小智:“三平、甲贺忍蛙!”
三平:“我发现你们以后，就偷偷跟着你们到这附近，没想到他们竟然察觉到我们的气息，你们也有所成长了呢，呱头蛙、甲贺忍蛙。”
“呱头~”
“扣~嘎!”他们正好赶上午饭。
小雪:“忍者村?”
三平:“正是如此，在下为了参加明天村里举办的祭典，长途跋涉赶着回去呢。”
柚莉嘉:“忍者村是什么样的地方，有很多忍者在里面吗?”
三平:“当然有很多忍者啊，村民跟宝可梦们全都日以继夜勤于锻炼。”
柚莉嘉:“那……有女忍者吗?”
三平:“当然了，有好漂亮的女忍者哦。”小雪他们一致决定出发。
几人来到了一处山谷的山洞三平敲了敲岩石。
“山……”
“川!”随后大门突然打开一条通道出现在大家面前两个忍者出现。
“三平欢迎回来!”
三平:“在下平安归来了。”
“他们是你的朋友吗?”
三平:“是的!”
“大家会很开心的，好了，快去吧。”几人进入通道没想到村子在一个巨坑中。
小雪:“好壮观哦~”
三平:“欢迎你们，这里正是忍者村。”
这里的村民开始祭典的准备工作
三平:“各位，我回来了!”
“是三平，喂……一平、二平!三平他回来了。”
两个跟三平非常像的忍者出现
二平:“三平，你平安归来了。”
三平:“二平哥跟一平哥看起来朝气蓬勃实在是太好了。”
二平:“呱呱泡蛙也进化成甲贺忍蛙了!”
三平:“他变得非常强悍哦……”
一平看向小雪他们:“三平，他们是……”
三平:“他们是在下的朋友。”
小雪他们进行了自我介绍
一平:“我弟弟受你们照顾了，我是三平的哥哥一平。”
二平:“我是二平大家做好朋友吧。”
“好……”
就在这时一个比较年长的忍者出现:“三平的朋友就是我们的朋友，半藏我也十分感激哦。”
三平:“头领在下平安回来了!”
“扣~嘎!”
半藏:“长途跋涉辛苦了，才藏已经告诉过我你们有所进步。”
“才藏殿下吗?”
半藏:“没错他也说了小雪的事情。”
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